Судова влада в Україні є обов’язковим елементом державної влади, взаємодіє із законодавчою і виконавчою владою на засадах принципу поділу влади.

Відповідно до Закону України «Про статус суддів» прийнятого в грудні 1992 року вперше судді визначаються носіями судової влади в Україні, що здійснюють правосуддя незалежно від законодавчої та виконавчої влади.

У зв’язку з внесеними змінами в червні 1992 року до Закону України «Про судоустрій» з 1 січня 1993 року Богодухівський народний суд перейменовано на Богодухівський районний суд Харківської області .

Основним завданням Богодухівського районного суду Харківської області є:

• здійснюючи правосуддя на засадах верховенства права, забезпечує кождному право на справедливий суд та повагу до інших прав і свобод, гарантованих Конституцією і законами України, а також міжнародними договорами, згода на обов’язковість яких надана Верховною Радою України .

За період з 2001 року по 2012 рік суттєвих змін у функціях та структурі Богодухівського районного суду не відбулося.

В період з 01.01.2004  по 31.12.2005  структура суду була такою:

• - голова суду -1 одиниця
• - суддя – 4 одиниці
• - помічник голови суду – 1 одиниця
• - помічник судді – 4 одиниці
• - консультант – 1 одиниця
• - секретар судового засідання – 5 одиниць
• - секретар суду – 3 одиниці
• - старший секретар – 1 одиниця
• - кур»єр – 1 одиниця
• - діловод – 1 одиниця
• - прибиральниця – 1 одиниця

З 01.01.2006  зі штату суду було виведено 1 суддю та 1 помічника судді та введено 1 – заступника голови суду та 1- помічника заступника голови суду.

З  01.01.2008 до штату суду було введено 3 посади :

    - керівник апарату – 1 одиниця

• - головний спеціаліст з інформаційних технологій – 1 одиниця
• - судовий розпорядник – 1 одиниця

З  01.12.2010  до штату суду було введено 1 посаду - головний спеціаліст з бухгалтерського обліку – 1 одиниця

З  01.04.2011  зі штату суду було виведено посаду головного спеціаліста з бухгалтерського обліку

З 01.07.2012 зі штату суду було виведено посаду консультанта та введено посаду заступника керівника апарату – 1 одиниця. Станом на 31.12.2019 штатна чисельність працівників Богодухівського районного суду Харківської області складала 26 осіб.